Le pluriel recommandé d'un tronc d'arbre est : des troncs d'arbres.
Toutefois, selon l'académie française :
L'usage veut plutôt le pluriel, en privilégiant le nombre d'arbres qui ont fourni ces troncs, mais le singulier, parce que chaque arbre n'a qu'un tronc, n'est pas incorrect.
L'orthographe des troncs d'arbre peut aussi être acceptée, même si l'écriture des troncs d'arbres est préconisée.
Voici quelques exemples :